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以下是 Transgenomics(IDT) 突變檢測試劑盒的正確操作規(guī)程

2025-09-22      90
  以下是 Transgenomics(IDT) 突變檢測試劑盒的正確操作規(guī)程:
  1.前期準(zhǔn)備
  -樣本采集與處理
  根據(jù)實驗需求選擇合適的樣本類型,如血液、組織等。按照說明書要求對樣本進行預(yù)處理,包括裂解細(xì)胞、提取核酸等步驟,以獲得高質(zhì)量的 DNA 用于后續(xù)實驗。確保提取過程中避免引入雜質(zhì)和抑制劑,以免影響后續(xù)反應(yīng)的準(zhǔn)確性。
  -儀器校準(zhǔn)與檢查
  確保所使用的儀器設(shè)備處于正常工作狀態(tài)。提前預(yù)熱 PCR 儀至適宜溫度,并檢查其程序設(shè)置是否符合試劑盒的要求。同時,準(zhǔn)備好干凈的微量移液器及配套槍頭,保證移液精度。
  -試劑解凍與混勻
  從 -20℃取出試劑盒后,讓其緩慢升溫至室溫。輕輕顛倒幾次使各組分充分混合均勻,但不要劇烈震蕩,防止產(chǎn)生氣泡或破壞酶活性。特別注意含有酶類的試劑,應(yīng)在冰上操作以保持其穩(wěn)定性。
  -配制反應(yīng)體系
  嚴(yán)格按照試劑盒說明書的比例取適量的主混合物,其中已包含除模板 DNA 外的所有必要成分。然后加入經(jīng)純化的模板 DNA,加無菌水補足至總體積到規(guī)定值。使用微量移液器準(zhǔn)確吸取各組分,每更換一種試劑最好更換一次槍頭,避免交叉污染。
  -加樣與離心
  將配制好的反應(yīng)液小心地加入到 PCR 管或板中。加樣完成后,輕輕混勻樣品并短暫離心,使液體集中于管底,確保反應(yīng)體系中各成分分布均勻。
  -設(shè)置 PCR 程序
  根據(jù)目標(biāo)基因序列的長度和 GC 含量等因素,參照試劑盒說明書建議設(shè)置熱循環(huán)儀的參數(shù),包括變性溫度、退火溫度及延伸時間等。例如,一般變性溫度可設(shè)為 94 - 95℃,退火溫度根據(jù)引物的 Tm 值確定,通常低于引物 Tm 值 5℃左右,延伸時間則依據(jù)片段長度調(diào)整。啟動 PCR 儀開始擴增反應(yīng)。
  3.酶切分析階段
  -準(zhǔn)備酶切反應(yīng)體系
  PCR 擴增完成后,取一定量的擴增產(chǎn)物進行酶切反應(yīng)。按照試劑盒提供的說明,加入適量的 SURVEYOR 酶和其他必要的緩沖液組件,構(gòu)建酶切反應(yīng)體系。注意控制好反應(yīng)體系的體積和各成分的比例。
  -孵育與消化
  將配好的酶切反應(yīng)體系在合適的溫度下孵育一定時間,讓 SURVEYOR 酶充分發(fā)揮作用,切割異源雙鏈 DNA 錯配位點。孵育過程中保持恒溫環(huán)境,避免溫度波動影響酶活性。
  -終止反應(yīng)
  到達(dá)預(yù)定的孵育時間后,采取適當(dāng)?shù)姆椒ńK止酶切反應(yīng),如加熱失活酶或者加入終止緩沖液。這樣可以防止過度消化導(dǎo)致結(jié)果不準(zhǔn)確。
  4.Transgenomics(IDT) 突變檢測試劑盒結(jié)果檢測與分析
  -選擇合適的檢測平臺
  該試劑盒支持多種檢測平臺,如標(biāo)準(zhǔn)膠電泳、熒光毛細(xì)電泳、LI - COR 等??筛鶕?jù)實驗室現(xiàn)有設(shè)備條件選擇合適的平臺進行檢測。如果使用凝膠電泳,需制備合適濃度的瓊脂糖凝膠;若采用熒光檢測系統(tǒng),則要確保儀器的性能良好且參數(shù)設(shè)置正確。
  -上樣與檢測
  將酶切產(chǎn)物小心地上樣到選定的檢測平臺上。對于凝膠電泳,要注意上樣量適中,避免過載影響條帶分辨率;在使用熒光檢測時,要保證樣品加載正確且無氣泡產(chǎn)生。然后運行檢測程序,獲取數(shù)據(jù)。
  -數(shù)據(jù)分析與解讀
  根據(jù)檢測結(jié)果進行分析。觀察切割片段大小能夠提示突變位點的位置,切割產(chǎn)物的數(shù)量能夠提示突變數(shù)是 1 個、2 個還是 3 個等。結(jié)合實驗?zāi)康暮皖A(yù)期結(jié)果,判斷是否存在突變以及突變的類型和位置。同時,注意排除假陽性和假陰性結(jié)果的可能性,可通過重復(fù)實驗或其他驗證方法來確認(rèn)結(jié)果的可靠性。